Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Hecw1Q8K4P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw1Q8K4P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hecw1Q8K4P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Hecw1Q8K4P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Hecw1Q8K4P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hecw1Q8K4P8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Hecw1Q8K4P8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Hecw1Q8K4P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Hecw1Q8K4P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Hecw1Q8K4P8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Hecw1Q8K4P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw1Q8K4P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms