Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf4Q8K4J2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf4Q8K4J2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ebf4Q8K4J2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf4Q8K4J2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ebf4Q8K4J2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf4Q8K4J2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf4Q8K4J2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf4Q8K4J2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf4Q8K4J2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms