Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ltbp4Q8K4G1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ltbp4Q8K4G1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ltbp4Q8K4G1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ltbp4Q8K4G1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ltbp4Q8K4G1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ltbp4Q8K4G1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ltbp4Q8K4G1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ltbp4Q8K4G1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ltbp4Q8K4G1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ltbp4Q8K4G1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms