Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf219Q8K2Y0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf219Q8K2Y0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf219Q8K2Y0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf219Q8K2Y0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf219Q8K2Y0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf219Q8K2Y0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf219Q8K2Y0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms