Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plac9Q8K262 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plac9Q8K262 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Plac9Q8K262 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plac9Q8K262 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plac9Q8K262 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plac9Q8K262 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plac9Q8K262 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plac9Q8K262 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms