Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700001C19RikQ8K168 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001C19RikQ8K168 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700001C19RikQ8K168 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700001C19RikQ8K168 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms