Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0S9

Snapc1, snRNA-activating protein complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc1Q8K0S9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc1Q8K0S9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc1Q8K0S9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc1Q8K0S9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms