Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H2-Q4Q8HWB2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H2-Q4Q8HWB2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2-Q4Q8HWB2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2-Q4Q8HWB2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2-Q4Q8HWB2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-Q4Q8HWB2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q4Q8HWB2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q4Q8HWB2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q4Q8HWB2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q4Q8HWB2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q4Q8HWB2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms