Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CopaQ8CIE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopaQ8CIE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CopaQ8CIE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopaQ8CIE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CopaQ8CIE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms