Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mterf1aQ8CHZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mterf1aQ8CHZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms