Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnka2ipQ8CH19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnka2ipQ8CH19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnka2ipQ8CH19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnka2ipQ8CH19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms