Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco1Q8CGU1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calcoco1Q8CGU1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calcoco1Q8CGU1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco1Q8CGU1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco1Q8CGU1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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