Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4932414N04RikQ8CEQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4932414N04RikQ8CEQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms