Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacnb2Q8CC27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb2Q8CC27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacnb2Q8CC27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacnb2Q8CC27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb2Q8CC27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb2Q8CC27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms