Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CntrobQ8CB62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CntrobQ8CB62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CntrobQ8CB62 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CntrobQ8CB62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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