Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms