Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4bp3Q8C7U1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4bp3Q8C7U1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4bp3Q8C7U1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
N4bp3Q8C7U1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
N4bp3Q8C7U1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4bp3Q8C7U1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
N4bp3Q8C7U1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4bp3Q8C7U1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
N4bp3Q8C7U1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4bp3Q8C7U1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
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