Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac7Q8C2B3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac7Q8C2B3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac7Q8C2B3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac7Q8C2B3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac7Q8C2B3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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