Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X7

Slco6c1, Solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6c1Q8C0X7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slco6c1Q8C0X7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slco6c1Q8C0X7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slco6c1Q8C0X7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco6c1Q8C0X7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco6c1Q8C0X7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slco6c1Q8C0X7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco6c1Q8C0X7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms