Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D4

Arhgap12, Rho GTPase-activating protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap12Q8C0D4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap12Q8C0D4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap12Q8C0D4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap12Q8C0D4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap12Q8C0D4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap12Q8C0D4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap12Q8C0D4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap12Q8C0D4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap12Q8C0D4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap12Q8C0D4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap12Q8C0D4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Arhgap12Q8C0D4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms