Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eda2rQ8BX35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eda2rQ8BX35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eda2rQ8BX35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms