Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp5Q8BX09 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp5Q8BX09 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp5Q8BX09 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbbp5Q8BX09 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms