Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc12Q8BW49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc12Q8BW49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc12Q8BW49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc12Q8BW49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttc12Q8BW49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc12Q8BW49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc12Q8BW49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc12Q8BW49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttc12Q8BW49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttc12Q8BW49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms