Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Catsper4Q8BVN3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Catsper4Q8BVN3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Catsper4Q8BVN3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Catsper4Q8BVN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms