Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcgF3Q8BTQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PcgF3Q8BTQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PcgF3Q8BTQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms