Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTG3

Tcp11l1, T-complex protein 11-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l1Q8BTG3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcp11l1Q8BTG3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tcp11l1Q8BTG3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tcp11l1Q8BTG3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcp11l1Q8BTG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tcp11l1Q8BTG3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tcp11l1Q8BTG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcp11l1Q8BTG3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms