Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rps6kb1Q8BSK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6kb1Q8BSK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6kb1Q8BSK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6kb1Q8BSK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6kb1Q8BSK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rps6kb1Q8BSK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms