Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdhaf3Q8BQU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdhaf3Q8BQU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdhaf3Q8BQU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdhaf3Q8BQU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf3Q8BQU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdhaf3Q8BQU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdhaf3Q8BQU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms