Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm10600Q8BQ57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10600Q8BQ57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10600Q8BQ57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10600Q8BQ57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10600Q8BQ57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm10600Q8BQ57 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms