Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms