Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap4Q8BMK4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ckap4Q8BMK4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap4Q8BMK4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap4Q8BMK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap4Q8BMK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms