Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rspo4Q8BJ73 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo4Q8BJ73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rspo4Q8BJ73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rspo4Q8BJ73 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo4Q8BJ73 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms