Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms