Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms