Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krr1Q8BGA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krr1Q8BGA5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krr1Q8BGA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krr1Q8BGA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krr1Q8BGA5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms