Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm2Q8BGA3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrtm2Q8BGA3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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