Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhot1Q8BG51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhot1Q8BG51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rhot1Q8BG51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhot1Q8BG51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhot1Q8BG51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms