Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dusp4Q8BFV3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dusp4Q8BFV3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dusp4Q8BFV3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Dusp4Q8BFV3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Dusp4Q8BFV3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dusp4Q8BFV3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dusp4Q8BFV3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms