Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amigo1Q80ZD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Amigo1Q80ZD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Amigo1Q80ZD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms