Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp8Q80YR6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8Q80YR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8Q80YR6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms