Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cdc42bpbQ7TT50 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdc42bpbQ7TT50 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdc42bpbQ7TT50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdc42bpbQ7TT50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdc42bpbQ7TT50 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms