Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf516Q7TSH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf516Q7TSH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf516Q7TSH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf516Q7TSH3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms