Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ62

Podn, Podocan, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodnQ7TQ62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PodnQ7TQ62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PodnQ7TQ62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PodnQ7TQ62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PodnQ7TQ62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PodnQ7TQ62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PodnQ7TQ62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PodnQ7TQ62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms