Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim17Q7TPM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim17Q7TPM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim17Q7TPM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim17Q7TPM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim17Q7TPM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms