Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno2Q7TNB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sbno2Q7TNB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbno2Q7TNB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno2Q7TNB8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno2Q7TNB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms