Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd1l2Q7TN88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd1l2Q7TN88 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd1l2Q7TN88 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd1l2Q7TN88 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd1l2Q7TN88 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd1l2Q7TN88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms