Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF3

Ndufa12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa12Q7TMF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa12Q7TMF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa12Q7TMF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa12Q7TMF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms