Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms