Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc6aQ78XR0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc6aQ78XR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc6aQ78XR0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc6aQ78XR0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc6aQ78XR0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
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