Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rph3alQ768S4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rph3alQ768S4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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