Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sned1Q70E20 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Sned1Q70E20 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sned1Q70E20 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sned1Q70E20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sned1Q70E20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sned1Q70E20 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms